Kawasan Andalan di Kota Ternate adalah: Pulau Ternate, Ternate Selatan, Ternate Utara dan Moti. Sektor unggulan di Kota Ternate ini adalah adalah: Perikanan, Perkebunan, Pariwisata, Industri, Perikanan laut, Pemerintahan, Perdagangan, Hotel & Restoran, serta Angkutan laut.
Sedangkan sub sektor unggulan di Kota Ternate adalah: Perikanan budidaya, Kopra, cengkeh, pala, kakao, Wisata bahari, wisata budaya industri gerabah, serta industri perikanan laut.