Kawasan Andalan di Kabupaten Halmahera Timur adalah: Wasile, Maba, Maba Selatan dan Wasile Selatan. Sektor unggulan di Kabupaten Halmahera Timur ini adalah adalah: Perkebunan, Pertanian, Perikanan laut, Pertambangan, Air bersih, serta Pariwisata.
Sedangkan sub sektor unggulan di Kabupaten Halmahera Timur adalah: Kopra, kakao, cengkeh, pala, tanaman pangan, cakalang, serta pertambangan emas.